Μέσα από τις στάχτες της προσφυγιάς με πρωτεργάτες τους Γιώργο Έλληνα και Χρίστο Νεοφύτου μαζί με άλλους νέους πρόσφυγες, οι οποίοι κατοικούσαν στο Μούτταλλο Πάφου, δημιούργησαν μια ομάδα που πρωταγωνιστούσε στο Πρωτάθλημα Π.Ο.Α.Σ.Π.
Η Ομάδα αξιώθηκε να αγωνιστεί μέχρι και την Δ΄κατηγορία ενώ συνεχίζει μέχρι σήμερα να είναι από τις καλύτερες ομάδες στο Αγροτικό Πρωτάθλημα της Πάφου.
H Αναγέννηση ιδρύθηκε το 1976 από πρόσφυγες που κατοίκησαν στον συνοικισμό Μουττάλλου μετά την Τουρκική εισβολή του 1974. Αρχικά αγωνιζόταν στις διοργανώσεις της Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας Αγροτικών Σωματείων Πάφου ενώ το 1986 εντάχθηκε στην Δ΄κατηγορία και στις τάξεις της ΚΟΠ.
Στην πρώτη της συμμετοχή στο πρωτάθλημα την περίοδο 1986-87 τερμάτισε στην 9η θέση του Ομίλου της. Την περίοδο 1987-88 υποβιβάστηκε στα Αγροτικά πρωταθλήματα αφού τερμάτισε 13η.
Το 1995 ενοποιήθηκε με την Ελπίδα Προσφύγων Πάφου δημιουργώντας την ομάδα “Αθλητική Ένωση Αναγέννηση Ελπίδα Προσφύγων Πάφου”